Церковь возведен в 1592 году, сначало из бревна. В 1702 году сообразно плану конструктора И. Зарудного на месте древесного был возведен неподвижный церковь. Колокольня и столовая построены в 1868 году перед управлением конструктора А. Каминского.
На протяжении всей собственной летописи Ильинский церковь ни разу никак не закрывался и в русское время собирал прихожан почти всех прикрытых столичных храмов.
При храме работает воскресная среднее учебное заведение для зрелых и деток, санкционирован доступный лекторий о столичных святынях.
Книгохранилище храма пророка Илии в Обыденском проулке г. Столицы пока суд да дело размещена в здании былого Ермаковского училища сообразно адресу: Столица, Пречистенская наб., д. 11, 2-й этаж.
